当对方代垫运费时，通常需要根据实际业务情况将其计入相应的科目。以下是一些常见的计入科目：
1. 销售费用：如果运费是销售商品的一部分成本，通常将其记入销售费用，与销售有关，计入“销售费用”科目。
2. 应收账款：如果运费是与销售相关的款项，并且对方代垫，那么可以将这部分款项记为应收账款。
3. 存货：如果运费用于购买原材料或库存商品，那么可以将这部分费用记入存货科目。
具体计入哪个科目还需要根据实际情况进行判断，并且需要在相关的凭证中记录清楚。对于不太清楚具体计入哪个科目的具体情况，可以咨询财务部门或相关负责人。
例如：
某公司销售部联系了一家物流公司运送一批货物到客户处，物流公司代垫了运费。会计人员需要将这部分费用记入销售费用科目。他们需要制作一张记账凭证，记录销售部支付的运费，并记入销售费用科目。
